Claudio Morgado

Campus Casa Central Valparaíso
claudio.morgado@usm.cl

Líneas de Investigación:

• Estudio computacional de la estructura, dinámica, y termodinámica de ácidos nucleicos y complejos supramoleculares

Área principal:

Fisicoquímica Teórica.

 

Líneas de Investigación

Desarrollo de software para simulaciones moleculares y de agentes autónomos.

 

Publicaciones indexadas (en los últimos 10 años o las 10 mejores)

1. Conformation change of opiorphin derivates. A theoretical study of the radical initiated epimerization of opiorphin János J. Szórád, Eszter P. Faragó, Anita Rágyanszki, Franco A. Cimino, Béla Fiser, Michael C. Owen, Balázs Jójárt, Claudio A. Morgado, Milán Szori, Svend J Knak Jensen, Imre G. Csizmadia, Béla Viskolcz. Chem. Phys. Lett., 2015, 626, 29.
2. Understanding the role of base stacking in nucleic acids. MD and QM analysis of tandem GA base pairs in RNA duplexes. Claudio A. Morgado, Daniel Svozil , Douglas H. Turner and Jiří Šponer. Phys. Chem. Chem. Phys., 2012, 14, 12580.
3. Comment on "Computational Model for Predicting Experimental RNA and DNA Nearest-Neighbor Free Energy Rankings". Jiří Šponer, Claudio A. Morgado and Daniel Svozil. J. Phys. Chem. B, 2012, 116, 8331.
4. Reference MP2/CBS and CCSD(T) quantum-chemical calculations on stacked adenine dimers. Comparison with DFT-D, MP2.5, SCS(MI)-MP2, M06-2X, CBS(SCS-D) and force field descriptions. Claudio A. Morgado, Petr Jurečka, Daniel Svozil, Pavel Hobza and Jiří Šponer. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 14, 3522.
5. Balance of attraction and repulsion in nucleic-acid base stacking: CCSD(T)/Complete-Basis-Set-limit calculations on uracil dimer and a comparison with the force-field description. Claudio A. Morgado, Petr Jurečka, Daniel Svozil, Pavel Hobza and Jiří Šponer. J. Chem. Theory Comp. 2009, 5, 1524
6. A QM/MM study of fluoro-aromatic interactions at the binding site of Carbonic Anhydrase II, using a DFT method corrected for dispersive interactions. Claudio A. Morgado, Ian H. Hillier, Neil A. Burton and Joseph J. W. McDouall. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 2706.
7. The interaction of carbohydrates and amino acids with aromatic systems studied by density functional and semi-empirical molecular orbital calculations with dispersion corrections. Raman Sharma, Jonathan P. McNamara, Rajesh K. Raju, Mark A. Vincent, Ian H. Hillier and Claudio A. Morgado. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 2767.
8. The non-covalent functionalisation of carbon nanotubes studied by density functional and semi-empirical molecular orbital methods including dispersion corrections. Jonathan P. McNamara, Raman Sharma, Mark A. Vincent, Ian H. Hillier and Claudio A. Morgado. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10,128.
9. The structure and binding energies of the van der Waals complexes of Ar and N₂ with phenol and its cation, studied by high level ab initio and density functional theory calculations. Mark A. Vincent, Ian H. Hillier, Claudio A. Morgado, Neil A. Burton and Xiao Shan. J. Chem. Phys. 2008, 128, 044313.

 

Proyectos de investigación (en los últimos 10 años o los 5 mejores)

1. Proyecto Quimal 2013-2016 (CONICYT): “High Performance Computing System for the Theoretical Search of Molecular Species in Astronomical Environments.”
2. Proyecto Fondecyt de Iniciación 2010-2012: “Predicción teórica del efecto de las bases flanqueantes en la estructura y dinámica de bucles internos de ARN que exhiben apareamientos GA o GU. Análisis del rol jugado por las interacciones de apilamiento en la preferencia conformacional de los bucles internos.”